2003年，申鑫（前身衡源）成立，开始参加中乙联赛；2005赛季，申鑫获得中乙冠军登陆中甲；2009赛季，申鑫获得中甲亚军，与辽足一起冲超成功。2013赛季，申鑫在中超的排名甚至力压申花和上港（前身东亚），成为上海滩的老大。
但到了2018赛季，在中甲苦熬日子的申鑫，已经到了崩盘的边缘，2019赛季，欠薪终于爆发，申鑫多次接近解散，但一波9连败，加上1次4连败和1次5连败，终于让申鑫提前3轮掉入中乙，而未来，这支球队何去何从却成为疑问。
2003赛季，申鑫成立，但1年后转投南昌，在南昌的日子里，申鑫从中乙打到中甲，又从中甲来到中超。2012赛季，申鑫重返上海滩，但回到上海的第一个赛季，申鑫就差点降级，排名倒数第2，但好在实德的解散，让申鑫侥幸留下。
但幸运的申鑫，却在2013赛季创造了史上的新高，获得了那个赛季的第6名，申花则是被扣6分起步的情况下，排在了第8位，上港则是位列第9，申鑫成为上海滩的老大。
不过2013赛季，是申鑫史上的唯一辉煌，也是最后的辉煌。2014赛季，申鑫的保级之路则较为顺利，而2015赛季，在上港获得联赛亚军，申花位列第6的情况下，申鑫垫底降级，由此开启了噩梦。
欠薪卖人，申鑫崩盘
2018赛季结束后，外援比罗比罗曝出申鑫欠薪，并且以此成为自由身，当时申鑫欠薪的问题就已经开始曝光。而2019赛季开始前，申鑫的主力叶重秋、吴毅臻等人纷纷离队，一线队球员大半出走，大半的球队主力离开，申鑫对外的说法是要锻炼年轻球员。
然而赛季未过半，申鑫欠薪的问题就不是秘密，甚至几度走到了解散的边缘。好在回上海足协和中国足协的“出手”，让申鑫数次躲过解散的悲剧，但此时的申鑫已经是积重难返，降级只剩下时间问题。
9连败+4连败+5连败，申鑫重回中乙
4-1击败贵州，是申鑫在中甲最后的辉煌，随即就是一波9连败，那也是申鑫欠薪曝光的前后，而且9连败期间，申鑫大比分输球频现，包括了2-9黄海、1-7梅州。好不容易止住连败之后，申鑫一波2连平之后，又是一波4连败.
客场2-1绝杀支云之后，申鑫截止本轮不敌绿城，遭遇了5连败，从15轮只拿2分，到这一次的5连败，申鑫终于降入了中乙。
